筚路蓝缕
1905年，于右任、邵力子等原震旦公学学生脱离震旦，拥戴马相伯在吴淞创办复旦公学。校名撷取自《尚书大传•虞夏传》“卿云烂兮，纠缦缦兮;日月光华，旦复旦兮”两句中的“复旦”二字，本义是追求光明，寓含自主办学、复兴中华之意。马相伯、严复等先后担任校长。1913年李登辉开始担任校长，一直到1936年。在他长达23年的校长任内，复旦发展成为一所以培养商科、经济、新闻、教育、土木等应用型人才闻名的、有特色的私立大学，形成了从中学到研究院的完整的办学体系。
1937年抗日战争爆发后，复旦部分师生在吴南轩校长带领下，辗转内迁重庆北碚(渝校)。1941年增设了农学院。经国民政府行政院批准，1942年元旦复旦由私立改为国立，全称为国立复旦大学，吴南轩、章益先后出任校长。1946年夏，渝校迁回上海江湾原址，与沪校合并，学校的规模进一步扩大。
两次腾飞
1949年6月，上海市军管会接管复旦。军管会任命张志让、陈望道担任校务委员会正副主任委员。1952年2月，中共复旦大学委员会成立，李正文任书记。1952年8月至9月，华东地区进行院系大调整，复旦大学成为人文社会和自然科学的全国重镇，奠定了后50年学科发展的基本格局和师资基础。
1954年，杨西光出任复旦大学党委书记。1956年复旦第一次党代会召开。五六十年代，杨西光、王零领导的学校党委支持校长陈望道狠抓教学质量，充分发挥老专家、老教授的作用，有计划、有重点地系统培养中青年骨干教师。期间，复旦的办学质量和办学条件都有瞩目的长足发展，形成了有特色的学科高原。1949—1966年，复旦培养的学生中有70余人日后当选为中国科学院或中国工程院院士，这个人数在全国高校中名列第三。
1958年“大跃进”，复旦大学理科新建了计算数学、力学、原子核物理、放射化学、无线电电子学、生物物理、生物化学等新专业。此前，文科重建了法律系、哲学系。这些新专业的创建，标志着复旦开始探索有自己特色的社会主义综合大学之路。1959年，复旦大学被列为全国16所重点大学之一。1966年到1976年，复旦大学成为“文革”的重灾区，教学科研受到重创。
1977年，复旦大学恢复招收本科生，次年恢复招收研究生。1978年，苏步青出任校长、党委委员，夏征农出任党委第一书记，进行了一系列拨乱反正工作，同时倡导民主办校，推动思想解放运动。1983至2011年，谢希德、华中一、杨福家、王生洪、杨玉良先后出任校长，盛华、林克、钱冬生、程天权、秦绍德、朱之文先后出任党委书记。
跨越发展
1984年，复旦大学成立研究生院。同年，再次被国务院批准为国家重点建设的10所高校之一。1993年2月，复旦大学提出了“追求优质，争创一流，明确复旦作为高校国家队的坐标位置”的发展大计，并逐步确立“建设世界一流大学”的总体奋斗目标。
1994年，复旦大学通过由国家教育部组织的“211工程”部门预审，提出了在21世纪初期，将复旦大学建设成为高层次人才培养、高水平科学研究、高科技成果转让和高规格决策咨询的中心和基地，成为学术思想活跃、学科特色鲜明、综合实力雄厚、精神面貌健康奋发、与上海国际化大都市地位相称的、具有世界一流水平的社会主义综合大学的总体奋斗目标，为此后十年制定了发展蓝图。1995年5月22日，中共中央总书记江泽民为复旦大学题词：“面向新世纪，把复旦大学建设成为具有世界一流水平的社会主义综合性大学。”
1999年国家教育部、上海市政府签定共建复旦大学的协议，复旦成为“985工程”的首批建设高校。2000年4月27日，复旦大学与上海医科大学强强联合，成立新的复旦大学。
2005年复旦大学百年华诞。中共中央总书记、国家主席、中央军委主席胡锦涛发来贺信，希望复旦大学发扬优良传统，不断开拓创新，努力建设成为具有世界一流水平的社会主义综合性大学，为建设中国特色社会主义伟大事业培养更多德才兼备的高素质人才，为全面建设小康社会、实现中华民族的伟大复兴作出新的更大的贡献。
复旦大学信息安全专业设立在计算机科学技术学院。
复旦大学计算机学科发展历史可追溯至1956年，我国第一台电子模拟计算机“复旦601型电子积分机”研制成功。1975年，计算机科学系成立，是全国高校中最早成立的计算机系之一。2008年5月，计算机科学技术学院在整合复旦大学计算机学科原有各方力量基础上成立，成为复旦大学的一个独立的二级学院，并建有依托学院办学的软件学院和国家保密学院。学院秉承复旦大学深厚的学术底蕴和人文传统，依托复旦多学科综合性大学的学科优势，面向国际前沿和学科发展趋势、面向国家重大战略需求和面向国民经济主战场开展学院各项工作，致力于将学院建设成为学科完整，有一定国际影响力的计算机学院。
进入新世纪以来，学院在学科建设、队伍建设、人才培养、科学研究、办学条件等各方面均取得了长足的进步。目前学院设有“计算机科学与技术”和“软件工程”两个一级学科，“计算机科学与技术”下设的二级学科“计算机软件与理论”为国家和上海市重点学科。学院拥有国家级实验教学示范中心、上海市智能信息处理重点实验室、教育部网络信息安全审计与监控工程中心，以及数据库、网络与信息安全、媒体计算、系统软件与软件工程和图像图形与信号五个研究所等教学科研机构。
学院师资力量雄厚，拥有一支学科结构合理、富有学术活力的教学科研队伍，现有在职教职工157人，其中专任教师115人。有教授22人(均为博士生导师)，研究员1人，副教授46人，任其他副高级职务13人。有“千人计划”1人(复旦大学特聘教授)，教育部“长江学者”讲座教授1人，复旦大学特聘讲座教授1人。
学院建立了覆盖本科生到博士生的完整人才培养体系。拥有计算机科学与技术博士后流动站和软件工程博士后流动站，计算机科学与技术和软件工程两个一级学科博士学位授予权，计算机软件与理论、计算机应用技术和计算机系统结构三个二级学科均有博士和硕士学位授予权。设有“计算机科学与技术”、“信息安全”、“软件工程”和“保密管理”四个本科生专业方向，同时还设有计算机技术领域和软件工程领域的全日制专业学位工程硕士教育和在职不离岗的工程硕士教育。国家级实验教学示范中心为全校多个学院的计算机课程提供配套实验课程教学，学院下属公共基础教研室为全校本科生提供计算机公共课程教育。截至2012年底， 学院拥有在校科学学位博士研究生174人，工程博士2人，科学学位硕士研究生358人，全日制专业学位工程硕士158人，非全日制工程硕士1176人，本科生760人。学院成立以来，人才培养成果显著，获全国优秀博士论文1篇，中国计算机学会优秀博士论文和上海市优秀博士、硕士论文多篇。
学院积极开展各项科研活动，在数据库、信息安全、媒体计算、软件工程、系统软件、计算机网络、算法理论、嵌入式系统等研究方向上，形成了鲜明特色和优势。近年来，学院教师承担了大量国家和地方政府的重大科研项目以及企业合作项目，年均科研经费超5000万元，先后获得多项国家级和省部级科技成果奖励，取得了一批有影响力的科研成果。
多年来，学院培养并向社会各界输送了一大批综合素质优异的毕业生。每年30%左右的优秀本科毕业生远赴海外继续攻读研究生学位，其中不乏世界一流名校，如斯坦福大学、耶鲁大学、卡耐基•梅隆大学、康奈尔大学等。
学院本科生就业率一直位于全校各专业前列，研究生就业率常年保持接近100%的高水平。学院的毕业生不仅成为谷歌、微软、IBM、百度、腾讯等国内外知名IT企业的优秀人才，而且凭借通用的计算机能力进入各级政府事业单位及金融领域工作，如各大银行、基金和证券公司等。同时，不少学生还选择远赴中西部和各地基层、重点单位就业，在全国的各行各业中发挥自身的聪明才智，践行复旦人的远大抱负和崇高理想。
信息安全专业培养以计算机技术为基础的现代信息安全领域方面的研究、教学和管理人才。要求学生在掌握扎实、全面的计算机基础知识和应用技能的基础上，对信息安全领域的基本理论、基本方法和基本实验技能有比较全面的掌握;对现代信息安全技术特别是网络安全技术的专门知识和专门技能有较为深入的掌握，了解这一领域的理论前沿、发展动态和主流技术;在程序设计、计算机网络、信息安全系统设计、学科交叉、团队合作研究等方面受到实践训练;熟练掌握一门外国语;具有较强的分析、解决问题和获取新知识的能力，能适应社会对信息技术人才的多层次、多角度需求。
主要课程：数学分析，线性代数，大学物理，程序设计，电子学基础，数字逻辑与部件设计，集合与图论，近世代数，数据结构，计算机体系结构，概率论与数理统计，应用数论，操作系统，数据库引论，信息论与编码，信息安全概论，密码学基础，软件工程，数据通信与计算机网络，信息安全标准与法律法规，网络程序设计，网络安全及工具等。
